吴孟超院士并未长期在上海东方肝胆外科医院（原海军军医大学第三附属医院）任职，但该医院与他的学术生涯有密切关联：
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工作经历
吴孟超院士是上海东方肝胆外科医院的创始人之一，曾任院长和所长，但他的主要工作经历集中在第二军医大学东方肝胆外科医院（原第二军医大学上海东方肝胆外科医院）。该医院由他主导创建，是肝胆外科领域的国家级重点学科和军队重点建设学科。
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学术影响
吴孟超院士在肝胆外科领域的贡献主要体现在学科建设、临床技术和人才培养上。他带领的团队将学科规模从“三人研究小组”发展为国际领先的肝胆疾病诊疗中心，培养了大批专业人才。上海东方肝胆外科医院作为其长期工作单位，承载了其学术思想和临床经验传承的重要部分。
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近期纪念活动
吴孟超院士2022年5月22日逝世后，上海东方肝胆外科医院于2022年5月23日至26日举办了追思活动，并在嘉定院区（原安亭院区）设立纪念设施。这些活动体现了医院对吴孟超院士的敬意和学术传承。
吴孟超院士虽与上海东方肝胆外科医院有深厚渊源，但其主要职业生涯并非在此医院完成，而是通过该平台推动了肝胆外科领域的全面发展。