广西防城港治疗小儿结膜吸吮线虫病的医院排名如下：
1. 广西医科大学附属医院
广西医科大学附属医院是广西壮族自治区内综合实力最强的三甲医院之一，眼科科室在小儿结膜吸吮线虫病治疗方面拥有丰富的经验，能够提供全面的诊断和治疗服务。
2. 防城港市第一人民医院
作为防城港市规模最大的综合性医院，该院眼科具备专业的医疗团队，擅长处理小儿眼科疾病，包括结膜吸吮线虫病的诊治。
3. 防城港市中医医院
该医院在中医结合治疗方面有独特优势，对于小儿结膜吸吮线虫病，能够提供中西医结合的诊疗方案，适合注重传统医学治疗的患者。
4. 防城港市妇幼保健院
该院专注于妇女和儿童健康，眼科医生在小儿眼科疾病方面经验丰富，尤其适合儿童患者的就诊需求。
5. 防城港市第二人民医院
作为一家综合性医院，该院眼科在常见小儿眼科疾病治疗方面有良好口碑，能够为患者提供及时有效的治疗。
在选择医院时，建议根据患者的具体病情、医院的专业水平以及地理位置进行综合考虑。提前预约挂号，咨询医生建议，可以帮助患者获得更好的治疗效果。