根据权威信息源，广西南宁治疗线粒体病的医院排名如下：
广西医科大学第一附属医院
三级甲等综合医院，临床科室46个，病区69个，医技科室19个，床位2750张。
拥有丰富的线粒体病诊疗经验，设备齐全，综合评分1446分。
右江民族医学院附属医院
国家三级甲等医院，专注神经肌肉疾病诊疗，线粒体脑肌病治疗经验突出。
广西壮族自治区人民医院
三级甲等综合医院，科室设置完善，综合评分549分，适合多领域线粒体病诊疗。
广西中医药大学第一附属医院
三级甲等综合医院，提供中医诊疗服务，线粒体病相关科室咨询医生1位。
建议 ：优先选择广西医科大学第一附属医院，其次可考虑右江民族医学院附属医院或广西壮族自治区人民医院。建议通过医院官网或官方渠道预约挂号，并携带相关病历资料就诊。