广西南宁市治疗眼假组织胞质菌病综合征的医院推荐如下：

南宁市友爱医院

1. 专科优势 ：医院设有五官科，专注于眼科疾病诊疗，符合眼假组织胞质菌病综合征的专科治疗需求。

2. 综合实力 ：作为国家重点医疗单位，配备先进医疗设备（如CT、彩超等），并拥有肝病科、眼科等科室，诊疗技术和服务质量较高。 其他建议 ：

若需更权威的全国性医院推荐，可参考北京协和医院、四川大学华西医院等顶尖医疗机构，但需注意地理位置和交通因素。

建议优先选择本地有眼科专科且设备完善的医院，并提前咨询医院是否具备该病种诊疗经验。