广东深圳治疗细菌性角膜溃疡的医院排名中，综合实力较强的包括深圳市眼科医院、中山大学附属第七医院、北京大学深圳医院等，这些医院以专业眼科团队、先进诊疗技术和高治愈率著称。

1. 深圳市眼科医院
   作为深圳首家公立三级甲等眼科专科医院，在角膜疾病诊疗领域经验丰富，配备微生物实验室和精准药敏检测系统，尤其擅长复杂细菌性角膜溃疡的个体化治疗。

2. 中山大学附属第七医院
   依托中山大学眼科中心资源，其角膜病专科注重多学科协作，开展角膜移植等高难度手术，对耐药菌感染病例有独特治疗方案。

3. 北京大学深圳医院
   眼科为广东省重点学科，拥有国际标准化层流手术室，采用“药物+手术”联合疗法，对重症溃疡患者提供24小时急诊绿色通道。

4. 其他推荐医院
   香港大学深圳医院（国际诊疗标准）、华中科技大学协和深圳医院（快速病原体基因检测技术）等也具备较高水平，患者可根据病情和地理位置灵活选择。

建议优先选择具备角膜专科的三甲医院，并提前确认专家坐诊时间。早期规范治疗是避免视力损伤的关键！