全国甲状腺治疗权威的医院排名如下：

1. 北京协和医院 ：甲状腺外科拥有顶尖的专家团队，对于各种甲状腺疾病，从常见的甲状腺结节、甲亢、甲减，到复杂的甲状腺癌等，医生可以进行精细化的诊断和治疗。

2. 上海交通大学医学院附属瑞金医院 ：甲状腺血管外科在手术治疗方面具有显著优势，医生注重应用微创手术，减少患者的创伤和痛苦。

3. 华中科技大学同济医学院附属同济医院 ：甲状腺乳腺专科是同济医院国家级重点学科—普通外科的重要组成部分，集甲状腺乳腺疾病早期诊断、综合治疗、乳腺微创诊断治疗为一体。

4. 四川大学华西医院 ：甲状腺外科是国内规模最大的甲状腺外科疾病诊疗中心之一，拥有完善的治疗体系和多个学科协作中心。

5. 昆明中研甲状腺医院 ：诊疗技术力量雄厚，以“精、尖、专”的突出优势著称，拥有大量的科技设备和资深医生。

6. 南昌大学第五医院 ：在治疗甲状腺疾病方面也有很好的口碑和效果。

7. 中南大学湘雅二医院 ：也是治疗甲状腺疾病的优选医院之一。

8. 北京丰台广济医院 ：以中医治疗甲状腺疾病著称，拥有众多知名中医医师。

9. 杭州甲康医院 ：擅长利用微波消融治疗甲状腺结节等肿块类甲状腺疾病，并擅长中西医结合治疗各种甲状腺疾病。

10. 成都西部甲状腺医院 ：专科医院，拥有成熟的诊治技术和设备，以及临床经验丰富的医师团队。

这些医院在甲状腺疾病的诊断和治疗方面都有较高的专业水平和丰富的临床经验，患者可以根据自己的实际情况和需求选择合适的医院进行治疗。建议在选择医院时，可以综合考虑医院的专科特色、医生团队、设备条件以及患者评价等因素。