北京协和医院的特需门诊与普通门诊有以下主要区别：

1. 挂号费用 ：

• 特需门诊的挂号费用显著高于普通门诊。例如，特需门诊的挂号费从原来的300元上涨到主任医师300元，副主任医师200元，特需医师服务费为自费，不能参与医保。

• 普通门诊的挂号费用较低，例如知名专家100元，主任医师80元，副主任医师60元，普通门诊50元，且可以报销。

2. 就诊环境 ：

• 特需门诊的环境相对较好，人少安静，患者与医生可以有充裕的时间交流。

• 普通门诊就诊病人较多，环境较为拥挤，患者与医生的交流时间可能不足。

3. 医生级别 ：

• 特需门诊的医生都是专家级，主要是高级职称专家坐诊。

• 普通门诊的医生多为主治大夫级别。

4. 服务内容 ：

• 特需门诊提供的服务包括更详细的诊断和治疗，每个患者相对看病的时间略长一些。

• 普通门诊的服务相对较快，但可能无法保证每位患者有足够的时间与医生交流。

5. 预约难度 ：

• 特需门诊的预约难度较大，挂号费较高，且不能参与医保。

• 普通门诊的挂号相对容易，且挂号费用较低，可以报销。

6. 检查费用 ：

• 特需门诊的检查费用比普通门诊贵约1倍，但可以报销。

• 普通门诊的检查费用为标准收费，也可以报销。

7. 其他注意事项 ：

• 挂特需门诊的号不能开普通门诊的检查。

• 特需门诊一般是在除了专家门诊日之外的另外的工作日，患者就诊时人数较少。

综上所述，北京协和医院的特需门诊在挂号费用、就诊环境、医生级别、服务内容、预约难度、检查费用等方面均与普通门诊存在明显差异。特需门诊更适合病情复杂、需要详细诊断和治疗的患者，但费用也相对较高。普通门诊则适合初次就诊、病情相对简单的患者，挂号费用较低，但可能需要排队等待，且医生与患者的交流时间可能有限。