合作医疗不报销的情况主要包括以下六种：
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自购药品 ：医疗费用中如果包含自购药品，是不予报销的。
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工伤费用 ：因工作原因导致的伤害，其医疗费用应由工伤保险承担，不属于新农合医疗保险的报销范围。
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第三方责任费用 ：如交通事故、打架斗殴等，这些费用应由第三方承担，新农合医疗保险不承担报销责任。
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非医保目录项目费用 ：使用不在医保报销目录中的药物、器械等所产生的费用不予报销。
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境外就医费用 ：在境外医院就医的患者，其医疗费用无法在新农合医疗保险中报销。
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公共卫生服务费用 ：如新冠病毒感染的疫病、艾滋病等，这些费用不属于医疗保险的报销范围。
建议在就医时，尽量选择医保定点医疗机构，并严格按照规定程序进行就医和购药，以避免不必要的费用损失。