手上寻常疣大部分都可以自愈，免疫力低下的情况下难以自愈。
手上的寻常疣是感染了皮肤低危型人乳头瘤病毒后引起的疾病，身体免疫力低下、局部皮肤屏障功能损伤等，是导致人乳头瘤病毒感染的内在因素。患了寻常疣后，随着时间延长，身体免疫系统抗病能力逐渐恢复，通过免疫系统的作用，可以将侵入皮肤上皮层内的人乳头瘤病毒逐渐清除体外，寻常疣的皮损逐渐缩小、消失，达到自愈的效果。手上的寻常疣自愈所需要的时间一般在三年左右。
如果患有恶性肿瘤、糖尿病、艾滋病等基础疾病，损伤了免疫系统功能，或者长期使用他克莫司、环磷酰胺等免疫抑制剂，导致免疫功能低下，难以将侵入体内的人乳头瘤病毒清除，寻常疣则难以自愈。
患了寻常疣，如果自身免疫系统功能正常，可以暂不治疗，等待其自愈；如果免疫系统功能低下，建议接受医学治疗，包括冷冻治疗、咪喹莫特乳膏等药物治疗。
