灭活疫苗是指人们在获得病毒以后，通过对其进行一定的处理，使病毒完全丧失活性，进而制成疫苗。这其实是一种被杀死的病毒，将其输入人体，既不会使人染病，又可以使人体产生抗体，抵抗病毒的入侵。比如百日咳疫苗、流脑疫苗就属于这一类。
减毒疫苗是将病原微生物包括细菌、病毒在人工条件下使其丧失致病性，但仍然保留繁衍能力和免疫原性，制成减毒活性疫苗。将减毒活疫苗接种于人体，使人体产生一次亚临床感染，类似于一次人工自然感染的过程，从而引起与疾病类似的免疫反应，使既不发病，又能够获得抵抗这种疾病的免疫力。减毒活疫苗在体内的作用时间长，往往只需要接种一次就可以产生稳定的免疫力，这一类疫苗有例如脊髓灰质炎疫苗、麻疹疫苗等等。
相对来说，减毒疫苗在效果上优于灭活疫苗，但同时也存在着这些病毒和细菌复制较多，可能造成比较大的临床症状或不良反应的情况。
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