婴儿的结膜炎是否会自愈，主要还是看是什么类型的结膜炎。婴儿的各方面都比较娇嫩，所以在用药的选择上都比较谨慎。对于妈妈们来讲，能不用药尽量都不用药。
如果不是特别严重的细菌性结膜炎，比如早上起来或者是偶尔发现眼睛发红，有少量的眼屎，这种通过生理盐水或者淡盐水的清洗，慢慢都能恢复，不需要进一步的治疗；如果有大量的脓性分泌物，就必须要治疗。一般用得比较多的，像红霉素滴眼液或者是左氧氟沙星滴眼液等等，也都是很安全的。
还有一种是过敏性结膜炎，这也是比较常见的。对于轻度的过敏性结膜炎，可以通过冰块冷敷、调整生活结构、避免过敏原的接触；但是比较严重的过敏性结膜炎，比如眼睛都已经出现发红或者是不清澈，或者症状非常明显，这种情况不用药很难恢复。
所以对于儿童用药，一般能不用尽量不用，该用的时候要尽量精选用药，少量用，快速用，达到尽快恢复的过程。
