原发性的痛经是指妇科检查生殖器官没有明显器质性病变的患者，一般多出现于月经初潮六到十二个月后，有排卵青春期少女或者已经生育的年轻妇女。原发性痛经的治疗，分为一般性的治疗，包括进行体育锻炼，增强体质，平时注意生活的规律，劳逸结合，注意适当的营养，充足的睡眠，消除恐惧、焦虑、精神负担，加强经期的卫生，避免剧烈运动，过度的劳累和防止受寒。药物治疗包括口服避孕药，可使40%的患者痛经症状明显的减轻，50%的患者痛经程度完全缓解。
因为功能性痛经主要是由于前列腺素合成前列腺素，物质释放增多，可以用抑制前列腺素合成的药物，抑制前列腺素的合成。舒缓子宫的平滑肌，在经前服用能起到预防痛经，在经期具有解痉止痛的作用。对于顽固性的痛经，通过手术治疗阻断来自盆腔的痛觉的信号传导。
事实上对功能性的痛经，很多的患者可能是由于子宫内膜异位症引起的，因为子宫内膜异位症分几种类型，像卵巢的子宫内膜异位囊肿，或者是子宫腺肌病，通过影像学可以做出诊断。还有腹膜型的子宫内膜异位症，必须通过腹腔镜才能明确诊断。所以如果超声没有发现器质性的病变，并不代表真正没有器质性的病变，可能对顽固性的痛经药物治疗无效的这部分患者，需要做一个腹腔镜的探查来明确痛经的原因。
