一般情况下，有疣体但HPV检查阴性可能是由于检测误差、取样不当、疣体处于潜伏期、局部免疫异常、感染其他未检测的HPV亚型等原因引起的。常见的治疗方法有冷冻治疗、激光治疗、电灼治疗、手术切除、外用药物治疗。如果发现有疣体，即使HPV检查阴性，也建议及时就医，明确原因后，在专业医生的指导下进行治疗。 1. 检测误差:检测过程中可能因为实验室设备故障、检测试剂问题等导致结果不准确。这种情况下可考虑换一家正规医院重新检测，以获得准确结果。 2. 取样不当:如果取样时没有取到含有病毒的细胞，就可能出现假阴性结果。此时可以再次进行规范取样检测，确保取样的准确性。 3. 疣体处于潜伏期:疣体刚出现时，体内病毒载量可能较低，在检测限以下，从而出现阴性结果。对于疣体可采用冷冻治疗，利用液氮的低温使疣体组织坏死脱落；也可进行激光治疗，通过激光的光热效应烧灼疣体。 4. 局部免疫异常:局部皮肤的免疫功能出现异常，可能影响检测结果。可使用外用药物治疗，如鬼臼毒素，使用时需严格遵医嘱，注意用法用量；还可以使用咪喹莫特，同样要在医生的指导下使用，避免不良反应。 5. 感染其他未检测的HPV亚型:目前的HPV检测可能无法涵盖所有的HPV亚型。如果是这种情况，对于疣体可采用电灼治疗，通过高频电针或电刀烧灼疣体；也可进行手术切除，直接将疣体去除。 除了上述原因还有可能由个体特殊体质、既往感染过病毒残留等原因引起。在发现疣体后，不要自行处理，避免搔抓以免引起疣体扩散或继发感染，同时保持局部清洁卫生，避免不洁性行为，积极配合医生进行进一步的检查和治疗。