一般情况下，有疣体但HPV检查阴性可能是由于取样误差、疣体处于潜伏期、局部免疫异常、检测方法局限性、其他病原体感染等原因引起的。常见的治疗方法有冷冻治疗、激光治疗、电灼治疗、手术切除、外用药物治疗。如果发现有疣体，即使HPV检查阴性，也建议及时就医，明确原因后，在专业医生的指导下进行治疗。 1. 取样误差:取样过程如果没有取到含有病毒的组织，可能会导致检测结果阴性。这种情况下可重新进行规范的取样检测。如果疣体较小，可采用局部刮取的方式，若疣体较大，可能需要多点取材。 2. 疣体处于潜伏期:在疣体刚刚出现时，病毒载量可能较低，处于检测下限以下，从而出现假阴性结果。对于这种情况，可先对疣体进行治疗，如冷冻治疗，利用液氮的低温使疣体组织坏死脱落；激光治疗，通过激光的热效应烧灼疣体。 3. 局部免疫异常:局部免疫功能低下时，机体可能无法有效清除病毒，即使病毒存在也可能检测不到。可通过增强局部免疫的方法来治疗，如外用咪喹莫特，它能刺激局部免疫细胞产生干扰素等细胞因子来对抗病毒，还有鬼臼毒素，可抑制细胞分裂，从而使疣体坏死脱落，这两种药物均需在医生的严格指导下使用。 4. 检测方法局限性:现有的检测方法可能无法检测出所有类型的HPV病毒或者存在一定的假阴性率。可考虑换用更先进或者不同原理的检测方法重新检测，同时针对疣体可采用手术切除的方式，直接将疣体去除。 5. 其他病原体感染:某些其他病原体感染可能导致类似疣体的病变。需要进一步鉴别诊断，如若是传染性软疣病毒引起的软疣，可采用疣体夹除术进行治疗。 除了上述原因还有可能由皮肤良性肿瘤、自身免疫性疾病累及皮肤等原因引起。在发现有类似疣体的病变时，不要自行处理，避免搔抓以免引起破损感染或者导致疣体扩散，同时应保持病变部位清洁干燥，避免与他人共用毛巾等生活用品，防止传染他人，及时就医明确诊断是非常重要的。