福建漳州治疗晶状体蛋白过敏性青光眼的医院排名中，漳州市医院和联勤保障部队第909医院表现突出，具有较高的专业水平。以下是具体分析：

1. 漳州市医院

漳州市医院是漳州地区综合实力较强的医疗机构之一，拥有专业的眼科团队和先进的诊疗设备。医院在治疗晶状体蛋白过敏性青光眼方面积累了丰富的经验，能够提供个性化的治疗方案。

2. 联勤保障部队第909医院

联勤保障部队第909医院作为一家三乙医院，在眼科疾病治疗方面具有较高声誉。其眼科团队擅长处理复杂的眼部疾病，包括晶状体蛋白过敏性青光眼，提供从诊断到治疗的一站式服务。

3. 龙海区第一医院

龙海区第一医院近年来在眼科领域发展迅速，尤其在青光眼及相关疾病的治疗上取得了显著成效。医院引进了先进的医疗设备，能够为患者提供高效、安全的诊疗服务。

4. 漳州市第三医院

漳州市第三医院以综合实力强、服务优质著称，其眼科科室在治疗晶状体蛋白过敏性青光眼方面也有一定优势。医院注重患者的就医体验，提供温馨舒适的诊疗环境。

总结与建议

漳州市医院和联勤保障部队第909医院是漳州地区治疗晶状体蛋白过敏性青光眼的首选医院，但患者可根据自身需求选择合适的医疗机构。建议在选择医院前，通过医院官网或电话咨询了解具体服务内容和预约流程，以便获得更便捷的诊疗服务。