在广西北海，社保基数为16600元时，扣税金额主要取决于个人应纳税所得额、税率以及各项扣除项。根据现行税法，个人所得税的计算涉及多个因素，包括基本减除费用、专项扣除、专项附加扣除等。 以下是对此问题的详细分析：

1. 1.基本减除费用：根据中国现行的个人所得税法，每位纳税人每月有5000元的基本减除费用。这意味着在计算应纳税所得额时，16600元的社保基数需要先减去5000元的基本减除费用。
2. 2.专项扣除：社保缴费本身属于专项扣除的一部分。假设社保缴费为16600元，扣除基本减除费用5000元后，剩余11600元需要进一步扣除社保费用。社保费用包括养老保险、医疗保险、失业保险等，具体比例因地区而异。假设社保总缴费比例为20%，则每月社保费用为3320元。扣除社保费用后，应纳税所得额为11600元-3320元=8280元。
3. 3.专项附加扣除：纳税人还可以享受专项附加扣除，如子女教育、继续教育、大病医疗、住房贷款利息、住房租金和赡养老人等。假设纳税人每月有2000元的专项附加扣除，那么应纳税所得额将进一步减少至8280元-2000元=6280元。
4. 4.税率和速算扣除数：根据个人所得税税率表，6280元的应纳税所得额适用3%的税率，速算扣除数为0。应纳个人所得税为6280元×3%=188.4元。
5. 5.综合以上计算，在广西北海，社保基数为16600元时，扣除基本减除费用、社保费用和专项附加扣除后，应纳税所得额为6280元，适用3%的税率，最终应纳个人所得税为188.4元。需要注意的是，实际扣税金额可能因个人情况的不同而有所变化，例如是否有其他专项附加扣除、是否有额外的收入来源等。建议纳税人根据自身实际情况进行详细计算，或咨询专业税务顾问以获得更准确的税务规划建议。

通过以上分析，我们可以看到，社保基数16600元的扣税金额受多种因素影响，个人应仔细核对各项扣除项，以确保税务计算的准确性。