​​广东肇庆社保基数12500元时，每月个人所得税约为540元​​。​​关键计算依据​​：扣除五险一金（按16%约2000元）和个税起征点5000元后，应纳税所得额为7500元，适用10%税率和210元速算扣除数，最终个税为540元。

1. ​​社保缴费基数与比例​​
   肇庆2025年社保基数下限为4246元（养老保险），上限26421元。个人缴费比例通常为：养老保险8%、医疗保险2%、失业保险0.2%，合计约10.2%。以12500元为基数，个人社保缴纳约1275元（12500×10.2%）。

2. ​​应纳税所得额计算​​
   税前工资12500元扣除社保1275元和起征点5000元后，剩余6225元为应纳税所得额。根据税率表，6225元属于10%档（3000-12000元），速算扣除数210元，因此个税为6225×10% - 210=412.5元。

3. ​​实际差异说明​​
   若五险一金比例不同（如公积金按5%-12%额外扣除），个税会进一步降低。例如，公积金按5%缴纳（625元），则应纳税所得额降至5600元，个税为350元。

​​总结​​：实际扣税需结合单位具体缴费比例，建议通过“粤省事”平台查询实时数据，或咨询当地社保部门确认专项附加扣除项（如子女教育、房贷利息等）以优化税负。