根据相关政策和搜索结果，关于医保代扣协议与个人自主缴费的问题，具体说明如下：

一、已签代扣协议后是否还能自主缴费

1. 不会重复扣款

   若已签订银行代扣协议，但后续自行操作缴费，银行不会重复扣款。若通过其他渠道（如银行、网银、第三方平台）成功缴费，税务机关将停止批扣该期医保费用。

2. 需主动取消代扣

   若希望完全停止代扣，需通过银行或社保机构主动取消代扣协议，否则系统可能默认自动延续。

二、自主缴费的可行方式

1. 线上渠道

   • 登录当地税务或社保官方平台（如“成都税务”微信公众号），在社保缴费模块确认个人缴费档次并绑定银行账户。

   • 部分地区支持通过全国统一的社会保险公共服务平台（如“国家税务总局四川省电子税务局”）办理。

2. 线下渠道

   • 携带身份证、户口簿等材料到社保机构或银行柜台办理缴费主体变更或代扣协议签订。

三、特殊情况处理

• 离职后个人缴费 ：若与单位解除劳动关系，需到社保部门办理缴费主体变更，重新签订代扣协议。

• 灵活就业人员 ：未在用人单位参保的灵活就业人员，需向社保机构申请登记并直接缴纳社保费。

总结

已签代扣协议的医保仍可自主缴费，但需注意：

1. 避免重复缴费，需先取消原有代扣协议；

2. 自主缴费需通过正规渠道办理，确保信息准确性；

3. 不同地区具体操作可能略有差异，建议提前咨询当地社保或税务部门。