根据相关法律法规和搜索结果，户口不在一起的情况下，配偶是否可以由对方缴纳医保需根据参保类型和地区政策判断，具体分为以下情况：
一、职工医保（单位参保）
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男方参保，女方无法直接参保
若男方已参加职工医保，女性配偶无法直接在男方单位参保，需通过以下方式解决：
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配偶参保 ：配偶可单独在户籍所在地或现居住地参加职工医保，需提供结婚证、身份证、居住证等材料；
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家庭共济 ：部分地区（如深圳）支持职工医保个人账户的资金共享，但需满足参保条件且仅限职工本人使用。
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灵活就业人员参保
若男方为灵活就业人员，可单独缴纳职工医保，但配偶无法直接共享其医保账户。双方可分别参保，但无法实现医疗费用的直接结算。
二、城乡居民医保（如新农合/城郊合）
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无法直接参保
城乡居民医保以户籍为单位参保，若女方户籍未迁至男方户籍地，则无法直接在男方参保。
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户口迁移后参保
女方若将户口迁至男方户籍地，可按新农合/城郊合规定参保。
三、其他特殊情况
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异地就医备案 ：若配偶在异地长期居住，可通过异地就医备案实现医疗费用的报销，但需满足当地参保条件。
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政策差异 ：部分城市（如深圳）探索了“家庭账户”模式，允许家庭成员共享医保个人账户，但覆盖范围有限且需满足参保条件。
总结
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职工医保 ：需根据就业状态和参保地政策，配偶可通过单独参保或家庭共济解决；
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城乡居民医保 ：需户口迁移后参保；
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灵活就业人员 ：配偶无法直接共享医保账户，需单独参保。
建议根据实际情况咨询当地医保部门，了解具体操作流程和材料要求。
