在黑龙江省牡丹江市，社保基数为13900元时，扣税金额主要取决于个人应纳税所得额、税率以及速算扣除数。 根据中国现行的个人所得税法，社保缴费和个人所得税的计算是分开的，社保缴费会影响应纳税所得额，从而影响最终的扣税金额。以下是对此问题的详细解析：

1. 1.社保缴费计算：社保缴费基数是13900元，社保缴费比例因地区和具体政策而异。一般来说，社保缴费包括养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险和生育保险等。以常见的比例为例，养老保险个人缴费比例为8%，医疗保险为2%，失业保险为0.5%，合计个人缴费比例为10.5%。社保个人缴费金额为13900元×10.5%=1459.5元。
2. 2.应纳税所得额计算：应纳税所得额=工资收入-五险一金-免征额。根据中国现行税法，个人所得税的免征额为5000元。应纳税所得额=13900元-1459.5元-5000元=7440.5元。
3. 3.个人所得税计算：根据中国现行的个人所得税税率表，应纳税所得额7440.5元适用的税率为10%，速算扣除数为252元。个人所得税=应纳税所得额×税率-速算扣除数=7440.5元×10%-252元=492.05元。
4. 4.总扣税金额：总扣税金额为社保个人缴费金额与个人所得税之和，即1459.5元+492.05元=1951.55元。

在黑龙江省牡丹江市，社保基数为13900元时，社保个人缴费金额约为1459.5元，个人所得税约为492.05元，总扣税金额约为1951.55元。需要注意的是，具体的社保缴费比例和个人所得税税率可能会根据政策变化而调整，因此建议定期关注当地最新政策以获取准确信息。

为了更好地规划个人财务，建议在了解社保和税务政策的基础上，合理安排收入和支出，确保在享受社会保障的合理避税并实现个人财富的保值增值。