根据2024年最新个人所得税法及搜索结果，黑龙江佳木斯社保基数为12500元时，扣除五险一金后的应纳税额计算如下：

一、扣除项目与标准

1. 五险一金个人缴纳比例

   五险一金个人缴纳比例可能为16%（具体比例需以当地最新政策为准）。

   • 五险一金个人缴纳金额 = 12500元 × 16% = 2000元

2. 个税起征点

   当前起征点为5000元，专项附加扣除项目（如子女教育、住房贷款等）可进一步减少应纳税所得额。

二、应纳税所得额计算

• 应纳税所得额 = 月工资 - 五险一金个人缴纳额 - 起征点

  = 12500元 - 2000元 - 5000元

  = 5500元

三、适用税率与速算扣除数

根据2024年税率表，5500元属于 第三档 ，适用10%的税率和210元的速算扣除数。

• 应纳个人所得税 = 5500元 × 10% - 210元 = 340元

四、注意事项

1. 社保基数差异

   若单位实际缴费比例与16%不同，需以单位核算为准。

2. 专项附加扣除

   建议结合家庭实际情况申报子女教育、住房贷款等专项附加扣除，可进一步降低税负。

总结

月工资12500元（社保基数）在佳木斯扣除五险一金（16%）和个税起征点后，应纳个人所得税为 340元 。实际申报时请以当地最新政策及单位核算为准。