根据我国现行医疗保障政策，职工医保（社保中的医疗保险）与新型农村合作医疗（新农合）存在以下冲突和注意事项：

一、政策冲突的核心原则

1. 禁止重复参保

   国家明确规定，职工医保与新型农村合作医疗属于同类医疗保障制度， 不得同时参加 。若已参保其中一种，需先停保另一种才能参保。

2. 待遇享受冲突

   若同时缴纳两种保险， 医疗费用只能选择其中一种报销 ，无法重复享受待遇。例如，职工医保报销比例通常为70%-85%，新农合为50%-70%，两者报销范围也存在差异。

二、特殊情况处理方式

1. 城乡医保合并

   城乡居民医疗保险（2021年整合了原新农合和城镇居民医保）与职工医保 不可同时参保 。若已参加职工医保，需停止城乡居民医保；若转为农村户籍并符合条件，可参加新农合。

2. 职工医保与商业医疗保险

   若已参加职工医保， 不能再参加新农合 ，但可购买商业医疗保险。两者属于不同保障层次，不冲突，但医疗费用需先报新农合，再报商业险。

三、缴费与转移建议

• 缴费标准差异 ：职工医保缴费基数与工资挂钩，年缴金额较高；新农合缴费标准较低，且无个人账户。

• 转移参保 ：若因就业或户籍变化需转换医保类型，需按流程办理转移手续。

• 报销范围差异 ：职工医保覆盖城市医疗机构，新农合主要覆盖基层医疗机构，建议根据就医地选择更合适的医保。

四、其他说明

• 农村户口职工 ：若在城镇就业并参加职工医保，需主动注销新农合；若返回农村，可重新参保。

• 历史缴费处理 ：已缴的新农合费用无法退还，建议参保前咨询当地医保部门。

职工医保与新农合不可同时参保，需根据户籍、就业状态选择适合的医疗保障方式。