关于新农合重复缴费的问题，以下是综合处理建议：

一、确认重复缴费原因

1. 系统或网络故障 ：部分地区因缴费渠道故障可能导致重复缴费，需联系当地医保或税务部门核实。

2. 家庭成员重复参保 ：若家庭成员分别以不同身份参保，需确认是否为同一人缴费。

二、处理方式

1. 退重缴费用

• 线下办理

  携带身份证、缴费凭证到当地医保中心或乡镇人民政府便民服务窗口，作废重复缴费的票据并申请退费。

• 线上办理

  通过税务微信公众号、支付宝生活号、电子税务局等渠道提交退费申请，需提供身份证、缴费凭证等材料。

2. 保留一份并终止另一份

若同时参加了其他医疗保险计划，可申请保留一份并终止另一份：

• 提交申请 ：向参保地医保管理机构提交书面申请，说明终止原因并附上证明材料。

• 审核处理 ：审核通过后，终止的保险计划将退回相应保费。

3. 等待合并或转移

若预计未来医疗保险制度会合并或转移，可暂时保留重复缴费：

• 关注政策 ：密切关注当地医保政策变化，待合并或转移时按新规定处理。

三、注意事项

1. 时间限制 ：重复缴费需在医保待遇开始前申请退费，否则可能影响后续待遇享受。

2. 地区差异 ：具体退费流程可能因地区政策不同存在差异，建议提前咨询当地医保部门。

3. 避免二次缴费 ：退费成功后需核对缴费记录，避免因操作失误再次缴费。

四、特殊情况处理

若通过上述方式无法解决，可向当地社保部门或12366纳税服务应用投诉，提供详细证据材料申请介入。

建议优先通过线上渠道办理退费，若需线下办理，可前往医保中心或乡镇人民政府便民服务窗口提交材料。