工伤使用了新农合仍然可以报销工伤费用。根据相关政策，工伤保险与新型农村合作医疗（新农合）并不冲突，可以同时适用。以下是详细说明：

1. 工伤保险与新农合的性质与覆盖范围

• 工伤保险：是用人单位为职工缴纳的一种社会保险，专门用于保障因工作原因受到伤害的劳动者。工伤医疗费用通常由工伤保险基金全额报销，不受其他医疗保险报销的影响。
• 新农合：是针对农村居民的一种医疗保障制度，主要解决因病产生的医疗费用。新农合的报销范围包括住院治疗、门诊费用等，但与工伤保险的适用范围和主管部门不同。

2. 工伤保险与新农合是否冲突

• 不冲突：工伤保险与新农合是两种独立的保障体系，适用的法律依据和主管部门各不相同。工伤医疗费用不会因新农合的报销而减少。
• 报销原则：工伤保险的医疗费用报销不与新农合的报销抵消，即使劳动者已通过新农合报销部分费用，用人单位仍需按照工伤保险的规定支付剩余的医疗费用。

3. 实际操作中的注意事项

• 报销流程：工伤职工在申请工伤保险报销时，应提交工伤认定决定书及相关医疗费用单据。工伤保险基金将根据工伤医疗目录全额报销相关费用，不受新农合报销的影响。
• 双重保障：工伤保险和新农合可以同时使用，为劳动者提供更全面的医疗保障。工伤保险优先报销工伤医疗费用，新农合则可报销非工伤相关的医疗费用。

4. 提示与建议

如果您已使用新农合报销了部分医疗费用，建议尽快申请工伤认定，并提交相关材料申请工伤保险报销。可咨询当地社保部门，了解具体的报销流程和所需材料，以确保权益得到充分保障。