内蒙古鄂尔多斯社保基数10000元与5000元的主要区别体现在养老金和医疗保险待遇上，具体分析如下：

一、养老金差异

1. 基础养老金计算

   养老金由基础养老金和个人账户养老金两部分组成。基础养老金的计算公式为：
   $$基础养老金 = \frac{（全省上年度在岗职工月平均工资 + 本人指数化月平均缴费工资）}{2} \times 缴费年限 \times 1%$$

   其中，缴费基数越高，计算出的基础养老金越高。

2. 实际领取金额

   假设其他条件相同，缴费基数10000元比5000元多缴纳50%的金额，理论上基础养老金也会相应提高约50%。

二、医疗保险待遇差异

1. 医保报销比例

   医疗保险的报销比例与缴费基数直接相关。缴费基数越高，医保目录内的药品、诊疗项目等可报销范围更广，报销比例也可能更高。

2. 起付线和封顶线

   较高的缴费基数可能降低医保起付线（即自费门槛）和封顶线（年度最高报销限额），减轻个人医疗负担。

三、其他潜在影响

• 滞纳金与转移接续 ：缴费基数越高，因缴费不足产生的滞纳金可能越少，未来转移接续社保时待遇更稳定。

• 养老金计发基数 ：退休后养老金计发基数通常与退休时当地平均工资挂钩，但缴费基数仅作为计算基础，实际计发金额还受退休年龄、指数化月平均缴费工资等因素影响。

四、注意事项

社保缴费基数仅影响个人账户待遇，不影响他人（如配偶、子女）的权益。若选择较低基数缴费以降低当期生活成本，需权衡长期养老和短期经济压力。

以上分析综合了社保政策的一般原则，具体待遇以鄂尔多斯当地最新规定为准。