山西晋城社保基数为6000元时，个人所得税的扣缴情况如下：

1. 1.社保缴费计算：养老保险：通常个人缴纳比例为8%，即6000元×8%=480元。医疗保险：个人缴纳比例一般为2%，即6000元×2%=120元。失业保险：个人缴纳比例一般为0.5%，即6000元×0.5%=30元。住房公积金：假设缴纳比例为12%，即6000元×12%=720元。总计社保缴费：480元+120元+30元+720元=1350元。
2. 2.应纳税所得额计算：起征点：目前个人所得税的起征点为5000元。应纳税所得额：6000元（社保基数）-1350元（社保缴费）-5000元（起征点）=-350元。由于应纳税所得额为负数，因此无需缴纳个人所得税。
3. 3.特殊情况说明：如果社保基数调整或当地政策有变化，可能会影响最终的应纳税所得额。某些地区可能还会有额外的扣除项目，如子女教育、继续教育、大病医疗等，这些都会进一步减少应纳税所得额。
4. 4.在山西晋城，社保基数为6000元的情况下，由于扣除社保费用和起征点后，应纳税所得额为负数，因此无需缴纳个人所得税。了解社保基数和个人所得税的关系，有助于更好地规划个人财务，确保合理避税。

通过以上分析，可以看出在山西晋城，社保基数为6000元时，个人所得税的扣缴情况主要取决于社保缴费和起征点的综合影响。合理利用税收政策，可以有效减轻个人税负。