医保停缴后是否可以继续缴纳农村合作医疗，需根据具体情况判断，具体说明如下：

一、缴费资格与时间限制

1. 无强制缴费限制

   农村合作医疗（新农合）的缴费时间通常为每年10月至12月，错过当年缴费期将无法享受当年医疗保障，但不会影响下一年度参保。

2. 断缴年限影响

   若连续多年未缴费，需重新计算等待期，且中断期间医疗费用无法报销。建议每年缴费以保持连续性。

二、缴费方式与操作流程

1. 线上续缴

   通过当地医保服务中心官网、社保App或微信公众号办理续缴手续，需确认缴费档次并上传身份证信息。

2. 线下办理

   携带身份证到户籍所在地或医保经办机构窗口办理缴费，部分地区支持代扣代缴。

三、注意事项

1. 职工医保与农合的参保选择

   根据我国法律规定，职工医保与农村合作医疗不能同时缴纳，需二选一。若已参加职工医保，停缴后需停止缴纳农合，反之亦然。

2. 缴费标准与待遇

   农村合作医疗实行分档缴费，不同档次对应不同报销比例。缴费后次年1月1日正式生效，保障期覆盖当年全年。

3. 特殊情况处理

   • 灵活就业人员可单独缴纳农合，但需承担全部费用；

   • 若因单位未缴导致断缴，可要求单位补缴或通过社保部门申诉。

四、法律依据

《社会保险法》第二十三条规定，无雇工的个体工商户、灵活就业人员等可自愿参加新型农村合作医疗，由个人缴费。若职工医保停缴，可选择参保农合，但需遵守“一人一户、一年一缴”的原则。

医保停缴后是否继续缴纳农合，需结合缴费资格、时间限制及个人需求综合判断，建议每年定期检查参保状态并及时续缴。