医保扣款重复可能由以下原因导致，需结合具体情况排查：

一、重复缴费

1. 缴费周期与系统延迟

   医保通常按月自动扣款，若缴费时间存在延迟，可能导致同一账户被多次扣款。例如，月初和月中各扣一次可能被误认为重复。

2. 缴费金额异常

   若两次扣款金额相同或接近，可能是缴费基数调整补扣或系统计算错误。需核对缴费明细确认是否为同一笔费用重复。

二、系统异常

1. 支付流程冲突

   在线下支付时，若因网络问题导致支付状态未成功提交，可能引发重复扣款。例如，收银员重复选择医保支付或系统未及时更新支付状态。

2. 医保系统故障

   医保机构或第三方支付平台可能出现系统漏洞，导致同一笔费用被多次处理。需联系医院、社保局或支付平台客服核查。

三、其他特殊情况

1. 退休人员缴费差异

   退休人员医保费用由个人和单位共同承担，若单位补缴或政策调整，可能引发多次扣款。

2. 地区政策差异

   不同地区医保缴费规则存在差异，部分地区可能实行“当月扣两次”的过渡政策。

建议处理方式

1. 核对缴费明细

   通过社保局官网或线下窗口打印缴费明细，对比扣款记录，确认是否为重复缴费。

2. 联系医保机构

   若发现异常扣款，应及时拨打12333社保热线或当地医保部门，提供缴费凭证和明细申请退费。

3. 避免自行处理

   不可自行删除银行卡或修改缴费账户，需通过正规渠道核实情况，避免影响其他社保待遇。

若问题仍未解决，建议保留相关证据材料，向医疗保障局或市场监管部门投诉。