医保在药店不能使用的原因可能有以下几点：

1. 药店不是医保定点药店 ：使用医保卡购药的前提是必须在医保的定点药店使用，否则只能选择自费或更换药店。

2. 医保个人账户没有余额 ：除了在定点药店购药，还要注意自身医保账户的余额是否充足，就是职工医保个人账户中有无余额，这直接对消费行为造成影响。

3. 所购药品不在医保目录范围内 ：因为医保报销药品是有范围的，并非任何药品都可以通过医保卡购买。可以在当地医疗保障网站查询医保药品目录或向药店工作人员进行问询，以免带来不必要的麻烦。

4. 参保城乡居民医保不具有个人账户 ：职工医保分为统筹账户和个人账户，而城乡居民医保则没有个人账户，居民个人缴纳的基本医疗保险费全部纳入统筹账户。

5. 医保卡消磁或损坏 ：如果医保卡消磁或损坏，将无法在药店刷卡使用。

6. 药店违规操作 ：有些药店可能因为违规操作被暂停刷卡服务，或者药店为了避税和多赚钱故意说刷不了需要自费。

7. 药品价格超过医保支付限额 ：有些药品的价格可能超过医保的支付限额，导致无法使用医保卡支付。

医保在药店不能使用的原因可能包括药店不是定点药店、医保个人账户余额不足、所购药品不在医保目录范围内、参保城乡居民医保没有个人账户、医保卡消磁或损坏、药店违规操作以及药品价格超过医保支付限额等。建议您在购药前仔细了解相关规定，确保能够在医保定点药店使用医保卡。