医保断交三个月后补缴会影响报销，但影响程度取决于断交时间、地区政策以及补缴情况。在大多数情况下，医保断交后补缴可以恢复报销资格，但可能会有一定的等待期或报销限制。以下是详细说明：

1. 1.断交时间的影响：断交三个月内：如果医保断交时间在三个月内，及时补缴后通常可以立即恢复医保待遇，不影响报销。这是因为许多地区的医保政策允许在一定时间内补缴并恢复待遇。断交超过三个月：如果断交时间超过三个月，补缴后可能会有一个等待期，通常为1到6个月不等。在等待期内，参保人无法享受医保报销待遇。不同地区的政策有所不同，具体等待期需参照当地医保政策。
2. 2.地区政策差异：一线城市：如北京、上海、广州等大城市，医保政策相对灵活，断交后补缴的等待期可能较短，甚至没有等待期。二三线城市：这些城市的医保政策可能较为严格，断交后补缴的等待期可能较长，影响参保人及时享受医保待遇。农村合作医疗：部分地区的新农合政策对断交补缴有更严格的规定，可能需要重新参保并缴纳一定期限的费用才能恢复报销资格。
3. 3.补缴方式的影响：全额补缴：如果能够全额补缴断交期间的医保费用，许多地区会允许参保人立即恢复医保待遇，不影响报销。分期补缴：部分地区允许分期补缴，但可能会设置一定的限制条件，如在分期补缴期间内报销比例降低或某些特定项目不予报销。
4. 4.特殊情况的处理：失业期间：如果参保人因失业导致医保断交，部分地区提供失业期间的医保补贴或允许在找到新工作后补缴，恢复医保待遇。退休人员：对于即将退休或已退休的参保人，医保断交补缴政策可能更为宽松，具体需参照当地退休人员医保政策。

总结来说，医保断交三个月后补缴确实会影响报销，但影响程度因断交时间、地区政策和补缴方式而异。为了避免不必要的麻烦，建议参保人尽量保持医保缴费的连续性，并在断交后及时咨询当地医保部门，了解具体的补缴政策和待遇恢复情况。