医保局查到住院病人不在病房，通常不会直接影响医保报销资格，但具体情况需结合政策规定和实际情形综合判断：

一、医保报销的核心依据

医保报销主要依据医疗费用是否符合医保目录及诊疗规范，而非病人是否在病房实际居住。单纯因病人不在病房通常不会导致报销被拒。

二、可能影响报销的特殊情况

1. 长期或连续缺勤

   若病人长期（如连续多日）未在病房居住，可能涉及医保违规行为，需医院和医保部门进一步调查。

2. 虚假住院或挂床

   若存在“挂床”（即办理住院手续但实际未住院）等违规行为，医保部门会追回相关费用。

3. 医保政策明确禁止的情况

   部分医保政策可能对住院时长、治疗方式等有明确要求，若不符合规定可能影响报销。

三、处理建议

1. 核对政策与费用

   首先确认医疗费用是否在医保报销范围内，及是否符合住院时长、诊疗规范等要求。

2. 与医保部门沟通

   提供医疗费用发票、诊断证明、病历等材料，说明情况并解释合理住院需求（如放疗需连续住院等）。

3. 提交申诉或投诉

   若沟通无果，可向医保局提交书面申诉，或向医保监管部门投诉。

4. 关注医院管理问题

   若因医院管理不善导致病人不在病房，可要求医院承担相应责任。

四、法律依据与权益保护

医保报销以法律法规和医保政策为依据，若医保部门存在不当拒报行为，可通过以下途径维权：

• 行政投诉 ：向医疗保障部门投诉

• 法律诉讼 ：因拒报导致损失时，可提起行政诉讼或民事诉讼

• 联合维权 ：多例类似情况可联合其他患者共同维权

建议患者保留好所有医疗费用凭证和沟通记录，作为维权的依据。