根据我国社保制度的发展历程，1999年缴纳的社保是否包含医疗保险，需结合具体情况分析：

一、1999年社保制度背景

1. 当时社保包含医疗保险

   1999年国家已经实现了社会养老保险的全国统筹，此时期的社保体系包含五大险种：养老保险、医疗保险、生育保险、工伤保险和失业保险，即现行的“五险”。

二、个人账户与统筹账户的差异

1. 医疗保险的缴费与待遇

   • 1999年社保中的医疗保险分为统筹账户和个人账户两部分：

     • 统筹账户由单位缴费，个人不缴费，主要用于支付门诊费用等小额支出；

     • 个人账户由个人缴费（约2%-4%），用于支付门诊大额费用或退休后的基础医疗保障。

   • 若个人账户累计缴费满15年，退休后即可享受医保待遇；若未缴满15年，则无法享受门诊报销等权益。

三、特殊情形说明

1. 灵活就业人员政策

   若1999年以灵活就业人员身份参保，可能仅缴纳养老保险，医疗保险需单独缴费。

2. 断缴影响

   若1999年后因单位倒闭等原因中断缴费，需补缴才能连续计算缴费年限。

四、建议与注意事项

1. 确认参保类型

   建议通过社保局或单位档案确认1999年参保时是否包含医疗保险，以及缴费方式（单位统筹/个人缴费）。

2. 补缴与待遇衔接

   若发现早期社保记录缺失，可联系单位补缴或通过社保局渠道申请补记，但需注意补缴后待遇的衔接问题。

1999年缴纳的社保通常包含医疗保险，但具体待遇取决于缴费方式和中断情况，建议通过官方渠道核实参保细节。