​​新农合在城市医院不能直接报销的核心原因在于其县级统筹的属地化管理模式、异地结算系统不完善以及政策对报销范围的限制​​。以下是具体分析：

1. ​​属地化报销限制​​
   新农合以县为单位统筹管理，报销范围通常限定在县级及以下定点医院。城市医院（市级及以上）不属于其直接结算网络，需患者先垫付费用，再回参保地提交材料人工报销。

2. ​​异地结算技术壁垒​​
   全国医保信息系统尚未完全联网，新农合与城市医院之间缺乏实时结算通道。即使部分省份开通异地备案，仍需提前申请且报销比例降低。

3. ​​政策导向与资金管控​​
   新农合旨在优先保障农村基层医疗资源使用，防止资金外流至城市大医院。部分地区要求转诊备案，未经县级医院转诊直接赴城市就医可能无法报销或比例骤减。

4. ​​重复参保冲突​​
   若同时参加新农合和城镇职工医保，政策禁止重复报销。户籍与就业地分离的农民工群体易因此被拒赔。

5. ​​材料与时效门槛​​
   异地报销需提供完整病历、发票、身份证明等，流程繁琐且时效严格（通常3-6个月），超期或材料缺失均导致失败。

​​提示​​：需跨市就医时，务必提前办理转诊备案，确认医院是否接入异地结算平台，并留存所有医疗票据。随着医保全国统筹推进，未来结算便利度有望提升。