新农合在三甲医院的报销规则如下：

一、基础报销比例

1. 常规住院报销比例

   • 三级医院（含省级及以上）：20%

   • 二级医院：30%

   • 一级医院（乡镇卫生院）：40%

2. 特殊病种报销比例

   • 持有《新型农村合作医疗特殊病种申报审批表》并备案的病种（如恶性肿瘤、肾透析等），报销比例可提高至70%-80%。

二、费用报销限额

1. 起付线

   • 三级医院起付线不低于1000元，部分城市（如长沙）可达2000元。

2. 单次住院最高支付限额

   • 通常为15万元，超过部分需自费。

3. 门诊费用限额

   • 普通门诊：无统一限额，但报销比例较低（如20%）。

   • 慢性病门诊（如高血压、糖尿病）：按病种门诊报销政策执行。

三、报销流程与注意事项

1. 住院登记

   • 患者需在三甲医院医保窗口办理住院登记，系统自动关联新农合信息。

2. 费用结算

   • 出院时直接结算，患者仅需支付自付部分，医保报销部分由医院与医保部门完成。

3. 报销范围限制

   • 高端病房床位费、美容整形手术等通常不在报销范围内。

   • 大型检查项目（如CT、核磁共振）需符合医保目录且费用≤200元。

4. 年度累计限额

   • 同一统筹期内多次住院费用可累计报销，但每年最高支付限额为15万元。

四、其他特殊政策

• 连续参保激励 ：连续参保3年以上，大病报销比例提高5%；5年以上提高3%。

• 60岁以上老人及儿童 ：门诊起付线降低至300元，报销比例提高至50%。

• 异地就医 ：需备案，报销比例可能降低5%-10%。

五、费用自付比例示例

以三级医院为例，若总医疗费用为10万元：

• 起付线1000元：自付9900元

• 可报销部分（8万元）：按20%比例报销，即1.6万元

• 总自付：9900元 + （10万 - 1.6万 - 15万限额） = 约1.39万元

注：具体比例可能因地区政策差异较大，建议参保前咨询当地医保部门。