医保患者住院90天结算规定是指‌参保人员单次住院超过90天需重新办理入院手续‌，主要涉及‌费用分段计算、起付线重新累计‌等关键点。这一规定旨在优化医疗资源分配，避免长期占用床位，同时保障患者医保待遇的合理享受。

1. ‌费用分段结算‌
   当住院时间超过90天时，系统会自动将费用分为两个结算周期。前90天按正常医保政策报销，第91天起视为"二次住院"，需重新生成费用清单。这种分段模式既不影响患者治疗连续性，又能确保医保基金合理使用。

2. ‌起付标准重置‌
   重新办理入院后，患者需要再次支付起付线金额。不同地区起付线标准各异，三甲医院通常高于基层医疗机构。但部分省市对恶性肿瘤等特殊病种设有豁免政策，具体情况需咨询当地医保局。

3. ‌特例处理机制‌
   对于重症监护、植物人状态等特殊情况，部分地区允许通过医院申报延长单次住院周期。需主治医师出具诊断证明，经医保经办机构审核后，可延长至120天或更久，期间不中断治疗。

4. ‌跨年度住院处理‌
   若住院时间跨越医保年度（12月31日），即使未满90天也需重新计算起付线。此时系统会生成两条结算记录，分别适用不同年度的医保目录和报销比例。

住院超90天结算新规既规范了医疗服务行为，也维护了患者权益。建议长期住院患者提前与医院医保办沟通，了解当地政策细则，必要时可申请特殊病种备案或分级转诊，最大限度减轻经济负担。出院时务必核对分段结算清单，确保费用拆分准确无误。