企业职工退休时医保缴费年限不足的处理方式如下：

一、补缴方式

1. 一次性补缴

   若退休时累计缴费年限未达国家规定（男性满25年/女性满20年且实际缴费不少于10年），可办理退休手续后一次性补缴差额年限。补缴基数通常按退休时当地职工医保最低缴费基数的8%计算。例如，某职工退休时差5年缴费年限，需补缴5年费用（按单位上年度职工人均缴费基数的8%计算）。

2. 继续缴费至满15年

   可选择继续按月缴纳医保费用，直至累计缴费满15年。期间仍可享受医保待遇。若选择这种方式，需承担个人缴费部分（单位缴费部分由原单位继续缴纳）。

二、其他选择

1. 转入居民医保

   若上述两种方式均不合适，可申请转入城乡居民医保，享受较低保障但费用更低的医疗保障。

三、注意事项

• 缴费基数与年限计算

  补缴时以退休时当地职工医保最低缴费基数为基准，缴费年限从退休次月开始计算。

• 地区政策差异

  不同地区对补缴年限、缴费基数等具体规定可能略有差异，例如辽宁省要求女性需缴满25年、男性30年且实际缴费不少于10年。

• 特殊情况处理

  若因单位缴费不足、政策调整等特殊原因导致缴费年限不足，需根据当地政策申请特殊处理。

建议根据自身经济状况和退休规划，结合单位政策选择最合适的处理方式。