同仁医院院区的区别主要体现在以下几个方面：

1. 位置不同 ：

• 崇文门院区 ：位于北京市东城区崇文门外大街6号。

• 亦庄院区 ：位于北京市大兴区亦庄开发区荣华南路29号。

2. 医疗设施和服务不同 ：

• 崇文门院区 ：设有青少年近视医疗中心、角膜和外眼病科等。

• 亦庄院区 ：设有眼底病科、眼肿瘤科、小儿眼科等。

3. 就诊环境和专家数量不同 ：

• 崇文门院区 ：也称为东西区，是同仁医院的老院区，出诊的医生较多，检查设备较全，就诊环境相对老旧。

• 亦庄院区 ：也称为南区，是同仁医院的新院区，出诊的医生较少，好的专家也较少，但硬件设施、仪器设备、软件条件等更加先进。

4. 功能定位不同 ：

• 崇文门院区 ：将主要承担中心服务、国际医疗、创伤救治和科研等功能，同时为周边居民提供医疗服务。

• 亦庄院区 ：将主要承担城南及亦庄地区居民医疗保障等疑难杂症会诊功能，依托医联体和专科联盟，促进优质医疗资源下沉。

5. 交通和便利性 ：

• 崇文门院区 ：位于北京市中心，交通便利，公交和地铁线路较多。

• 亦庄院区 ：位于北京经济技术开发区，交通便利，地铁亦庄线可达。

建议 ：

• 如果患者主要治疗眼底病、眼整形等，且居住在崇文门附近，可以选择崇文门院区。

• 如果患者主要治疗角膜病、白内障、近视等，且居住在亦庄附近，可以选择亦庄院区。

• 如果患者需要高端医疗服务或国际医疗，崇文门院区的特需门诊和专家资源可能更适合。

• 如果患者需要缓解北京南部的医疗压力，或者居住在亦庄地区，亦庄院区将提供更多的医疗资源和服务。