根据相关政策和搜索结果，针对低保户在学校缴纳医保后的处理方式，综合解答如下：

一、医保缴纳冲突的解决途径

1. 申请退还已缴费用

   若低保户在享受政府补贴的医保期间自行缴纳了医保，可向学校或当地医保部门申请退还已缴费用。需提供低保证明、缴费凭证等材料。

2. 与学校协商

   部分学校可能允许学生暂停或终止医保缴纳，建议与学校医保管理部门沟通，说明家庭经济状况，争取学校理解并协助处理。

二、对低保资格的影响

• 低保资格不受影响

  低保的发放主要依据家庭人均收入和财产状况，与是否缴纳医保无直接关联。即使学生自行缴纳了医保，只要家庭仍符合低保条件，低保待遇不会被取消。

三、注意事项

1. 政策差异处理

   不同地区对低保户医保缴纳政策存在差异，建议优先咨询当地社保局或民政部门，确认具体规定。

2. 保留相关证明材料

   申请退还费用时需提供完整证明材料，如低保证明、缴费记录、家庭收入证明等，以支持申请。

3. 关注政策动态

   医保政策可能随时间调整，建议定期关注当地医保部门发布的最新通知，避免因政策变化影响权益。

四、补充说明

若因转交大学生医保导致家庭经济困难，可向当地社保部门申请医疗救助，提供低保证明、医疗费用发票等材料。

建议优先通过学校渠道申请退费，并咨询当地民政、社保部门确认政策细节，以确保权益得到保障。