根据相关政策和搜索结果，低保户申请退回合作医疗费用的流程和注意事项如下：

一、退费申请方式

1. 线下申请

   需向当地医保经办机构或社保服务中心提交书面退费申请，并提供相关证明材料（如身份证、户口本、合作医疗卡、医疗费用明细等）。

2. 线上申请

   部分地区支持通过税务缴费系统或当地社保中心官网/APP申请退费。操作步骤通常包括：登录系统→进入退费账户信息采集页面→提交退费信息并等待审核。

二、特殊注意事项

1. 低保户资格审核

   低保户需确保其低保资格有效，并提供当地民政部门出具的低保证明（如低保证明、收入证明等）作为辅助材料。

2. 退费条件

   • 多缴费用退还 ：仅限个人多缴部分的医疗费用可申请退还。

   • 特殊疾病或异地就医 ：部分情况下（如异地报销后多缴、重大疾病等）可申请专项补助或调整缴费基数，需提供额外证明材料。

3. 地区政策差异

   具体退费流程和所需材料可能因地区政策不同存在差异，建议提前咨询当地医保部门或社保中心。

三、操作建议

• 优先线下办理 ：线上渠道可能因系统延迟或材料审核不通过导致退费失败，建议优先提交纸质材料。

• 保留沟通渠道 ：线上申请需关注系统反馈，若超过规定时间未处理，可联系当地社保中心咨询。

低保户申请退回合作医疗费用需结合自身实际情况，优先通过线下渠道提交完整材料，并核实当地具体政策。