云南省文山壮族苗族自治州治疗腋下疼痛的医院推荐如下：

一、专业皮肤病专科医院

文山壮族苗族自治州皮肤病防治所（文山州皮肤病专科医院）

• 科室优势 ：作为二级皮肤病专科医院，该机构承担全州麻风病、性病、皮肤病的防控、诊疗、研究及培训任务，具备皮肤科专科诊疗能力，可针对腋下疼痛相关的皮肤疾病（如腋窝淋巴结核、皮肤感染等）提供专业治疗。

二、综合医院皮肤科

1. 文山州人民医院

   • 皮肤科是云南省重点专科，拥有先进的诊疗设备和技术团队，可处理复杂皮肤疾病及疼痛相关问题。

2. 文山州第二人民医院

   • 皮肤科在皮肤病诊疗方面有丰富经验，具备处理腋下疼痛的综合治疗能力。

三、其他推荐医院

• 文山州第三人民医院

• 文山州中医医院 （中医皮肤科可结合传统疗法与现代技术）

四、就医建议

1. 初步诊断 ：若腋下疼痛伴随皮疹、红肿等症状，建议优先到皮肤病专科医院进行专业检查（如细菌培养、影像学检查等）。

2. 转诊流程 ：若需进一步专科治疗，可联系上述医院皮肤科，通过转诊绿色通道安排诊疗。

3. 医保覆盖 ：文山州皮肤病防治所作为公益一类事业单位，诊疗项目纳入医保报销范围，可减轻就医负担。

如需更详细的科室信息或挂号指南，可访问文山州医疗保障局官网或医院官方平台查询。