关于合作医疗的管理部门，需根据具体情况进行区分：
一、管理部门的归属
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新农合（新型农村合作医疗）
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管理部门 ：已随医保体制改革划归 医保局 （原卫生局）管理，具体可咨询当地医保局或新型农村合作医疗管理中心。
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咨询方式 ：
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登录当地医保局官网，通过社保编码、密码查询；
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拨打12333服务热线咨询；
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前往医保办事大厅或乡镇医保代办点办理。
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城镇职工合作医疗
- 管理部门 ：由 人力资源和社会保障局 （原劳动局）负责管理，具体可咨询当地人社局或医保科。
二、办理相关业务的部门
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参保登记与缴费 ：
- 乡镇民政部门、村委会、社区，或居住地社保经办机构、乡镇人力资源和社会保障服务机构。
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医疗费用报销 ：
- 在县（市）、乡（镇）、村定点医疗机构就诊时，直接减免或报销部分费用。
三、其他注意事项
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政策咨询 ：建议通过当地医保局官网、微信公众号或12333热线咨询，避免因地区差异导致信息误差。
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特殊情况处理 ：若对管理部门有疑问，可向市一级市长信箱投诉，或向卫生行政部门反映。
以上信息综合了国家医保体制改革后的管理框架及各地实际操作情况，具体以当地最新政策为准。
