根据相关法律法规及政策规定，合作医疗断交第二年是否可以续缴，需结合当地政策及缴费时间综合判断，具体说明如下：

一、基本原则与缴费规则

1. 一年一缴制

   合作医疗通常为一年一缴制，缴费时间集中在每年9月至12月，次年1月1日起生效。

2. 缴费与待遇关联

   • 若在缴费期内完成缴费，可享受次年医保待遇；

   • 若错过集中缴费期，需补缴且可能面临待遇等待期（30-90天）或需承担全额费用。

二、断缴后的续缴可能性

1. 补缴机会

   即使连续两年未缴费，仍可在第三年缴费期内补缴，但需符合当地政策要求。

2. 待遇影响

   • 补缴后 ：从补缴次月开始恢复医保待遇，可报销医疗费用；

   • 未补缴 ：第二年将无法享受医保报销，需等到下一缴费期重新参保。

三、地区政策差异

不同地区对断缴后的续缴规定存在差异，主要体现在：

• 补缴时间限制 ：部分地区要求在缴费期内补缴，错过则需重新参保；

• 补缴费用 ：部分地区补缴需承担个人及政府补贴部分，费用可能增加；

• 待遇等待期 ：补缴后通常需等待30-90天才能使用医保报销。

四、建议与注意事项

1. 确认缴费时间 ：关注当地医保部门发布的缴费通知，避免错过集中缴费期；

2. 咨询当地政策 ：不同地区规定差异较大，建议通过医保部门或官方渠道核实具体条款；

3. 及时补缴 ：若因特殊原因断缴，应尽早联系相关部门办理补缴手续，减少医疗费用损失。

合作医疗断交第二年仍可续缴，但需符合当地缴费时间、程序及待遇等待期要求。建议参保人及时关注政策动态，确保医疗保障不中断。