城镇医保和合作医疗（原新农合）是两种不同的医疗保险制度，主要区别体现在以下几个方面：

一、覆盖人群

1. 城镇医保

   • 覆盖城镇职工（包括企业职工、机关事业单位人员等）及灵活就业人员。

   • 非从业居民（如学生、儿童、老年居民等）可参加城镇居民医保。

2. 合作医疗（原新农合）

   • 仅限农村户籍居民参加，以家庭为单位整户参保。

   • 城镇非从业居民（如未就业大学生、流动人口等）可通过城乡居民医保（2016年后与原新农合合并）参保。

二、缴费标准与来源

1. 城镇医保

   • 由用人单位和职工共同缴纳，职工个人缴费部分计入个人账户。

   • 政府补贴仅适用于职工医保。

2. 合作医疗

   • 主要由农民自愿参加，实行个人缴费、集体补助和政府补贴相结合。

   • 缴费标准低于职工医保，且无政府补贴。

三、待遇标准与报销比例

1. 城镇医保

   • 报销比例较高，例如：

     • 一级医院：900元起付，1万元以下按9%报销；

     • 二级医院：600元起付，1万元以下按9%报销；

     • 三级医院：300元起付，1万元以下按9%报销。

   • 年最高封顶线高于合作医疗。

2. 合作医疗

   • 报销比例较低，例如：

     • 乡镇卫生院：60%报销，40%自费；

     • 县级医院：70%报销，30%自费；

     • 市级医院：60%报销，40%自费。

   • 年最高封顶线低于城镇医保。

四、保障待遇侧重点

1. 城镇医保

   • 侧重住院及门诊大病保障，普通门诊也有一定比例报销。

2. 合作医疗

   • 以大病统筹为主，门诊待遇（如慢性病门诊）优于住院待遇。

五、其他差异

• 管理部门 ：城镇医保由人社部门管理，合作医疗多由卫生部门管理。

• 政策演变 ：2016年后原城镇居民医保与原新农合合并为城乡居民医保，覆盖范围更广。

总结

城镇医保和合作医疗在覆盖人群、缴费标准、报销比例和待遇重点上存在显著差异。选择时需根据户籍、就业状态及医疗需求决定。若已参加城镇医保，则无需再参加合作医疗。