根据最新政策及权威信息，农村合作医疗与城镇合作医疗的区别已随制度整合而发生变化，具体区别如下：

一、制度整合背景

新型农村合作医疗（简称“新农合”）已与城镇居民医疗保险合并为 城乡居民医疗保险 ，统称“城乡居民医保”。这一改革于2016年全面启动，旨在统一城乡居民的医疗保障制度，消除城乡医疗保障差距。

二、参保对象与户籍要求

1. 新农合

   • 仅限农村户籍居民参加。

   • 2025年统一纳入城乡居民医保后，不再区分农村户口和城镇户口。

2. 城镇居民医保

   • 覆盖未参加城镇职工医保的城镇未成年人、失业人员、非从业居民等。

三、缴费标准与方式

1. 缴费标准

   • 城乡居民医保的缴费金额普遍低于职工医保，但高于新农合（约200元/年）。

   • 政府补贴比例高于新农合（约400-500元/人/年）。

2. 缴费方式

   • 城乡居民医保实行 按人缴费 ，不再区分农村或城镇户籍。

四、报销比例与待遇

1. 门诊报销

   • 村卫生室：70%报销，居民自付30%。

   • 乡镇/社区卫生服务中心：60%报销，居民自付40%。

   • 城市医院：报销比例普遍低于新农合（如三甲医院仅30%）。

2. 住院报销

   • 乡镇卫生院：不低于85%报销。

   • 县级医院：不低于70%报销。

   • 市级医院：不低于60%报销。

3. 大病保障

   • 城乡居民医保的门诊大病报销比例高于新农合，且封顶线也更高。

五、保障期限与管理

• 城乡居民医保为 终身保障 ，缴费年限达到规定年限后自动享受待遇。

• 管理部门统一为 人社部门 ，与职工医保并入统一体系。

六、其他差异

• 社保范围 ：城乡居民医保仅包含医疗保险，而职工医保属于社保五险之一。

• 商业补充 ：商业医疗保险可补充职工医保不足部分（如百万医疗险）。

总结

新农合与原城镇合作医疗的差异已通过制度整合消除，城乡居民医保成为覆盖城乡的统一医疗保障制度。参保人员可根据自身经济状况选择是否参保，并享受相应的医疗保障待遇。