根据您描述的情况，农村医保缴费显示失败但实际已扣款，可能由以下原因导致，并需采取相应处理措施：

一、常见原因分析

1. 银行账户问题

   • 银行账户余额不足或账户状态异常（如冻结、销户）可能导致扣款失败，但系统仍可能完成扣款操作。

   • 建议通过银行APP/网银查询账户流水，确认扣款是否成功。

2. 系统延迟或信息错误

   • 网络系统延迟可能导致扣款状态更新滞后，或参保信息、银行账号等录入错误。

   • 可尝试刷新页面或等待1-2小时后再试，或联系当地医保部门核查缴费记录。

3. 第三方平台故障

   • 使用的缴费平台（如楚税通、社保APP）可能出现临时故障，导致显示异常。

二、处理建议

1. 关注账户状态

   • 检查银行账户是否收到扣款通知，若已扣款但账户无记录，需联系银行处理。

   • 关注医保缴费平台或当地税务部门的缴费记录查询渠道（如“河南税务”微信公众号）。

2. 联系缴费方处理

   • 通过当地医保局官网、热线（如12366）或缴费平台客服反馈异常情况，提供缴费凭证申请人工审核。

   • 若因银行原因未到账，需联系银行客服追踪资金流向。

3. 避免重复缴费

   • 若系统锁定缴费信息，需等待下次缴费周期，避免因重复缴费影响个人信用记录。

三、特殊情况处理

• 账户信息错误 ：需携带身份证、户口本等材料到乡镇合医办或医保局更正。

• 长期欠费影响 ：连续欠费可能导致次年医保待遇中断，建议及时补缴。

四、注意事项

• 若在缴费截止时间后仍未收到退还款，建议通过12366或当地医保部门渠道查询欠费处理进度。

• 老年人或行动不便者可委托子女或银行工作人员协助处理。

请根据自身情况选择合适处理方式，若问题持续未解决，建议优先联系当地医保部门（如12366）获取专业帮助。