当企业实际支付金额与发票金额不一致时，需根据具体原因进行账务处理，主要分为以下几种情况：
一、销售折让（发票金额大于实际支付金额）
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调整入库成本
按实际支付金额入库，差额计入“应付账款”或“预付账款”。 例如： $$借：库存商品 5000.27$$
$$贷：银行存款 5000$$
$$贷：应付账款 0.27$$若后续对方不追讨差额，需转入“营业外收入”。
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调整进项税额
需计算实际应抵扣的增值税额，并转出多抵扣的进项税。 例如： $$借：原材料 97万$$
$$应交税费-进项税额 13万$$
$$贷：银行存款 110万$$应转出进项税： $$借：原材料 0.35万$$
$$贷：应交税费-进项税额转出 0.35万$$ 。
二、现金折扣（发票金额大于实际支付金额）
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按发票金额入账
现金折扣与销售无关，按发票金额确认应付账款，实际支付时冲减。
三、发票金额小于实际支付金额
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补足发票或调整支付
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补足发票 ：与供应商协商补开发票差额部分。
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调整支付 ：直接按实际金额支付，差额通过“应付账款”核算。
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四、其他注意事项
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误差处理 ：若因对方开票错误导致金额差异且差异较小，可按《企业会计准则》第22条，采用简化处理，直接调整当期损益，无需重新开票。
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税务合规 ：处理时需确保增值税计算准确，避免因差额引发税务风险。
示例综合处理
若企业收到发票金额1000元，实际支付980元（可能因销售折让），处理如下：
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入库分录 ：
$$借：库存商品 980$$
$$贷：银行存款 980$$ -
调整进项税 （假设税率为13%）：
实际应抵扣进项税： $$980 \div (1+13%) \times 13% = 12.14万$$
应转出进项税： $$13万 - 12.14万 = 0.86万$$
调整分录： $$借：应交税费-进项税额转出 0.86万$$
$$贷：应交税费-进项税额 0.86万$$
通过以上方法，可规范处理发票与支付金额不一致的情况，确保财务数据准确性。
