合作医疗二次报销的办理地点和流程如下：

一、办理地点

1. 参保地社保中心或新农合大厅

   二次报销需在参保人户籍所在地或居住地的社保中心或新农合管理部门办理。

2. 县级以下定点医疗机构

   部分流程（如住院报销）需在定点医疗机构提交初步材料。

二、所需材料

• 门诊报销 ：门诊发票、合作医疗证历本（或病历）、费用明细清单、出院小结等。

• 住院报销 ：住院发票、合作医疗证历本（或病历）、费用明细清单、出院小结、特殊病种证明（如门诊病历、诊断证明等）。

• 特殊病种报销 ：门诊发票、特殊病种合作医疗证历本、病历、化验报告单、照片等。

三、办理流程

1. 提交申请

   通过村（居）委会、乡镇合作医疗办公室或社保中心提交材料。

2. 审核与公示

   村（居）委会进行材料审核并公示，无异议后提交县级部门。

3. 费用结算

   完成初次报销后，持结算单到指定机构申请二次报销，最终通过银行转账返还。

四、注意事项

1. 报销比例

   二次报销比例通常为50%，具体比例因地区政策而异，一般在20%-60%之间。

2. 报销限额

   每年设有起付线、封顶线等限制，超过部分才能报销。

3. 定点医院要求

   门诊报销需在定点医院就医，乡镇民营医院通常不在报销范围内。

建议办理前咨询当地社保中心，确认具体材料及流程，避免遗漏。