公司社保医保停缴后补缴是否会影响待遇，需根据断缴时长和地区政策综合判断，具体影响如下：

一、医疗保险影响

1. 待遇恢复时间

   • 断缴3个月内补缴：次月可恢复医保待遇，但中断期间医疗费用无法报销。

   • 断缴超过3个月：需1-6个月等待期（部分地区规定更久），且连续缴费年限重新计算，影响退休后报销额度和比例。

2. 连续缴费年限

   • 短期断缴（≤1年）：补缴后年限不累计。

   • 长期断缴（>1年）：补缴后年限重新计算。

二、养老保险影响

• 养老金计算 ：断缴期间不计入缴费年限，退休时总缴费年限减少，可能导致养老金降低。

• 特殊人群处理 ：北京户籍可办理延期缴费，外地户籍需累计缴费满10年才能延期。

三、其他险种影响

1. 生育保险

   • 断缴期间无法享受生育津贴和医疗费用报销。

2. 失业保险

   • 断缴可能影响失业金领取期限和金额。

3. 工伤保险

   • 与医疗保险同步中断，需恢复缴费后享受待遇。

四、注意事项

• 补缴时效 ：部分地区规定补缴需在欠费后2年内完成，超过则无法补缴。

• 滞纳金 ：补缴时可能产生滞纳金，按同期银行一年期利率计算。

• 地区差异 ：具体等待期、年限计算规则因地区政策不同存在差异，建议咨询当地社保机构。

建议公司及时与员工沟通补缴计划，避免因政策差异导致额外损失。