关于农村合作医疗报销1000元的情况，需根据就诊级别和费用类型综合计算，具体如下：

一、门诊报销（1000元以内）

1. 村卫生室/中心卫生室

   报销比例60%，但设有10元处方药费限额。

2. 乡（镇）卫生院

   报销比例40%，处方药费限额100元。

二、住院报销（1000元起付线）

1. 起付线标准

   • 一级及以下医疗机构：600元

   • 二级及以上医疗机构：800元

   • 市外二级及以上医疗机构：1000元。

2. 报销比例

   • 一级及以下：60%-80%

   • 二级：40%-55%

   • 三级：30%-45%。

3. 示例计算

   • 若在二级医院住院花费1000元：

     • 起付线800元，剩余200元按40%报销，即80元。

三、其他注意事项

1. 检查费/手术费限额

   门诊检查费限额200元，手术费超过1000元按1000元报销。

2. 大病补偿

   住院费用超过5000元可分段补偿，例如5001-10000元补偿65%。

3. 地区差异

   具体比例可能因地区政策不同存在差异，建议咨询当地医保部门。

总结

• 门诊1000元 ：若在村卫生室可报销600元（含10元药费限额）；若在乡卫生院报销400元。

• 住院1000元 ：通常可报销600-800元，具体取决于医院级别。

建议患者根据实际就诊情况，结合当地医保政策计算报销金额。