新农合住院两次报销的起付标准根据医疗费用类型和医疗机构级别有所不同，具体如下：

一、大病二次报销起付标准

1. 总费用超过1.5万元

   新农合大病二次报销的起付线为 1.5万元 ，即患者自付费用超过该金额后，合规费用方可纳入报销范围。

二、门诊费用二次报销起付标准

1. 200-500元

   门诊费用二次报销的起付线为 200-500元 ，具体金额根据定点医疗机构的级别确定：

   • 乡级：200元/次

   • 县级：300元/次

   • 县级以上：500元/次

三、住院费用二次报销起付标准

1. 按医疗机构级别划分

   • 乡级定点医院：200元/次

   • 县级定点医院：300元/次

   • 县级以上定点医院：500元/次

补充说明

1. 起付线调整

   不同地区对起付线标准存在差异，例如河南省为0.75万元，建议参保人员咨询当地医保部门确认具体标准。

2. 报销比例

   合规费用超过起付线后，报销比例根据医疗机构级别和参保类型（在职/退休）确定，一般在50%-95%之间。

3. 年度累计限制

   部分地区对大病二次报销设有年度累计起付标准（如800元），超过后才能纳入报销。

以上信息综合了全国不同地区的政策，具体以参保地最新规定为准。